北陸先端大学 川上勝
本動画では、総括班の川上が考案した方法を用いて作製されたSecDFの分子模型を紹介しています。 SecDFは、細菌のタンパク質の分泌を促進する膜タンパク質で、12回の膜貫通領域と、2つのペリプラズムドメイン(P1とP4）を持ちます。SecDFは、膜透過チャネルから出て来た基質タンパク質分子を自身のP1ヘッドサブドメインで捕捉し、プロトン駆動力を用いたP１ドメインの構造変化により、基質分子を引っぱり膜透過を促進すると考えられています。 この模型は透明なシリコーン樹脂が分子表面形状を正しく造型しており、内部の主鎖構造が透視でき、分子表面を触って確認できます。またＰ１部分の交換により、SecDFの２つの異なった構造状態（F型とI型）の分子モデルが実現可能です。使用者は模型を手に取り、パーツを組み立てることで、SecDFの構造を深く理解できます。また他者とのディスカッションにも本模型は大変有用です。
Nature 474, 235–238 (09 June 2011)
Rev. Sci. Instrum. 83, 084303 (2012)
(2013.03.15)